Genetic diversity of East African Highland bananas using AFLP

• Authors : Tugume, A.K.; Lubega, G.W.; Rubaihayo, P.R.


• Document type : Journal article


• Year of publication : 2002


• Journal title : Infomusa


• Volume (number) : 11 (2)




• Pages : 28-32


• Peer-reviewed : No


• ISSN : 1023-0068


• Language(s) : English


• Abstract : Amplified fragment length polymorphism (AFLP) was used to delineate genetic relationships among 115 East African Highland bananas. Nei's genetic distance data matrices were established based on absence or presence of amplified polymorphic fragments. Phylogenetic relationships were determined by subjecting the genetic distance data matrices to UPGMA cluster analysis. The East African highland bananas showed close genetic relationships to one another, mainly attributed to the possible occurrence of retrotransposon activity on the narrow genetic base of these genotypes. The cooking and beer banana accessions grouped into four subclusters (Musakala, Nfuuka, Nakitembe, and Nakabululu). Nfuuka subcluster was the smallest and probably gave rise to the other subclusters. Musakala was the most distinct subcluster, Nakitembe and Nakabululu were the closest subclusters, while Musakala and Nakabululu were the least related subclusters.
  
  [Étude de la diversité des bananiers des hautes terres d'Afrique de l'Est avec la technique AFLP. Le polymorphisme de longueur des fragments amplifiés (AFLP) a été utilisé pour déterminer les relations génétiques entre 115 bananiers des hautes terres d'Afrique de l'Est. Des matrices des distances génétiques utilisant la méthode de Nei ont été établies sur la base de la présence ou l'absence de fragments polymorphes amplifiés. Les relations phylogénétiques ont été déterminées en soumettant les matrices de distance génétique à une analyse UPGMA. Les bananiers des hautes terres d'Afrique de l'Est se sont avérés génétiquement proches les uns aux autres, résultat attribué à la l'activité possible d'un rétrotransposon sur la base génétique étroite de ces génotypes. Les bananes à cuire et à bière ont été groupées en quatre sous-groupes (Musakala, Nfuuka, Nakitembe, et Nakabululu). Le plus petit est le sous-groupe Nfuuka qui est probablement à l'origine des autres sous-groupes. Musakala est le sous-groupe le plus distinct, Nakitembe et Nakabululu sont les sous-groupes les plus proches alors que Musakala et Nakabululu sont les sous-groupes les moins étroitement reliés.]
  
  [Diversidad genética de los bananos de altiplanos de Africa Oriental utilizando AFLP. La técnica de polimorfismo de longitud de fragmentos amplificados (amplified fragment length polymorphism, AFLP) fue utilizada para delinear las relaciones genéticas entre 115 bananos de altiplanos de Africa Oriental. Se establecieron las matrices de los datos de la distancia genética de Nei basadas en ausencia o presencia de los fragmentos polimórficos amplificados. Las relaciones filogenéticas se determinaron sometiendo las matrices de datos de las distancias genéticas al análisis de conglomerados UPGMA. Los bananos de altiplanos de Africa Oriental mostraron entre sí estrechas relaciones genéticas, lo que se atribuye principalmente a la posible ocurrencia de la actividad de retrotransposones sobre una angosta base genética de estos genotipos. Las accesiones de los bananos de cocción y cerveceros fueron reunidas en cuatro subgrupos (Musakala, Nfuuka, Nakitembe, y Nakabululu). El subgrupo Nfuuka fue el más pequeño y probablemente dio origen a otros subgrupos. El Musakala fue el subgrupo más diverso, el Nakitembe y el Nakabululu fueron los subgrupos más cercanos, mientras que el Musakala y el Nakabululu fueron los subgrupos menos relacionados.]


• Keywords : GENETIC MARKERS; TAXONOMY; GENETIC VARIATION; CLASSIFICATION; EAST AFRICAN BANANAS; UGANDA


• Open access : Yes


• PDF :


• Musalit document ID : IN030532_eng

If you want to link this record, use this url : musalit.org/seeMore.php?id=14196