Analysis of genetic diversity and phylogenetic relationships among indigenous and exotic 'Silk' (AAB) group of bananas using RAPD markers

• Authors : Uma, S.; Sudha, S.; Saraswathi, M.S.; Manickavasagam, M.; Selvarajan, R.; Durai, P.; Sathiamoorthy, S.; Siva, S.A.


• Document type : Journal article


• Year of publication : 2004


• Journal title : Journal of Horticultural Science & Biotechnology


• Volume (number) : 79 (4)




• Pages : 523-527


• Peer-reviewed : Yes


• ISSN : 1462-0316


• Language(s) : English


• Abstract : Natural transgression between Musa acuminata and Musa balbisiana, the well accepted progenitors of Musa spp., has led to the evolution of modern bananas and plantains with various ploidy levels and genomic constitutions. 'Silk' is an important group of triploid, dessert bananas of bispecific origin (AAB). Tough it has wide geographic distribution across the globe; the variability seems to be very limited. This study was undertaken with 25 'Silk' group representatives of both indigenous and exotic origins. The genetic variation and phylogenetic relationships were analysed using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) markers. Out of the 80 primers screened, 34 primers produced reproducible bands and only four primers were selected for the polymorphic study. A total of 35 DNA fragments across all materials were amplified with four random primers, averaging 8.75 per primer. Within the amplified fragments, 18 showed polymorphism with an average of 4.5 per primer. The average polymorphism among the amplified products was 51.2 percent indicating the existence of considerable variation at the DNA level among the test accessions. Most of the commercial Silk clones formed only two clusters and the extent of variability ranged only between 0-30 percent. The results indicate, irrespective of wider distribution of Silk group members across the globe, the spectrum of variability is very narrow. (Author's abstract).
  
  [La transgression naturelle entre Musa acuminata et Musa balbisiana, les ascendants démontrés des Musa spp., a conduit à l'évolution des bananiers modernes et des plantains dotés de niveaux de ploïdie et de constitutions génomiques variés. Le groupe 'Silk' est un groupe important de bananiers dessert d'origine bispécifique (AAB) triploïdes Bien que sa distribution géographique dans le monde soit étendue, sa variabilité semble très limitée. Cette étude a été entreprise avec 25 spécimens du groupe 'Silk' d'origine indigène et exotique. La variation génétique et les corrélations phylogénétiques ont été étudiées par l'analyse des marqueurs RAPD. Sur les 80 amorces criblées, 34 ont produite des bandes reproductibles et seulement quatre ont été choisies pour une étude polymorphique. Un total de 35 fragments d'ADN sur tout le matériel a été amplifié avec quatre amorces aléatoires avec une moyenne de 8,75 par amorce. Dans les fragments amplifiés, 18 ont présenté un polymorphisme avec une moyenne de 4,5 par amorce. Le polymorphisme moyen parmi les produits d'amplification a été de 51,2 pourcent indiquant l'existence d'une variation considérable au niveau de l'ADN parmi les accessions testées. La plupart des clones commerciaux de Silk forment seulement deux groupes et l'étendue de la variabilité varie de 0 à 30 pourcent. Les résultats indiquent que malgré la large distribution des membres du groupe Silk dans le monde, le spectre de la variabilité est très étroit (Résumé d'auteur).]


• Keywords : GENETIC MARKERS; VARIETIES; DNA; PHYLOGENY; RAPD; SILK AAB; BIODIVERSITY; GENETIC DISTANCE


• Open access : No


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